Projekta nosaukums: Genomikā un transkriptomikā balstīta maz raksturotu Streptomyces spp. celmu antimikrobiālo mehānismu kombinēšana antagonistisku sinkomu veidošanai pret ošu kalšanu un ozolu akūto kalšanu izraisošiem patogēniem
Projekta identifikācijas Nr.: lzp-2024/1-0109
Projekta izpildes termiņš: 2025. gada 1. janvāris – 2027. gada 31. decembris
Projekta kopējais finansējums: 300 000,00 EUR
Projekta koordinators: Latvijas Universitāte
Sadarbības partneris: Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
Projekta zinātniskais vadītājs BMC: Dr. biol. Dāvids Fridmanis
Projekta kopsavilkums:
Projekta mērķis ir izmantot antimikrobiālo pazīmju savietošanas paņēmienu, lai, kombinējot komplementārus Streptomyces celmus, izveidotu efektīvu antagonistisku sintētisko sabiedrību (SynCom) kas inhibē platlapju koku slimību izraisītājus. Izveidotie SynComi tiks mērķēti cīņai pret trim patogēniem – Hymenoscyphus fraxineus, Gibbsiella quercinecans un Brenneria goodwinii, kas saistīti ar divām platlapju koku sugu slimībām – ošu kalšanu un ozolu akūto kalšanu. Šis pētījums izmantos genomiku un transkriptomiku, lai izzinātu antimikrobiālos mehānismus, kas pārstāvēti maz pētītos Streptomyces celmos no Latvijas Mikroorganismu kultūru kolekcijas. Izmantojot genomikā un metatranskriptomikā balstītu metabolisko modelēšanu, tiks paredzētas efektīvākās antagonistisko celmu kombinācijas, kas tiks pārbaudītas ar antagonisma testiem. Rezultāti: 2 zinātniskās publikācijas, 2 ziņojumi zinātniskās konferencēs, aizstāvēts maģistra darbs, jauns projekta pieteikums, genomikas un metatranskriptomikas dati deponēti publiskajos datu repozitorijos. Ietekme: pētījuma rezultāti sniegs jaunas fundamentālās zināšanas koku patoloģijā un mikroorganismu ekoloģijā, kā arī veicinās vietējo mikrobioloģisko resursu pieejamību un pielietojamību. Vietējās izcelsmes Streptomyces celmu kolekcijas antimikrobiālo īpašību noteikšana veicinās inovācijas zināšanās-balstītas bio-ekonomikas jomā – Latvijas viedās specializācijas stratēģijas prioritārajā virzienā. Kopējais budžets: 300 000 EUR, ilgums: 36 mēneši.
Informācija publicēta 02.01.2025.