Projekta nosaukums: IT platformas izveide bērnu ļaundabīgo audzēju genoma datu uzglabāšanai, analīzei un interpretācijai

Projekta izpildes termiņš: 2024. gada 1. oktobris – 2025. gada 30. septembris

Projekta kopējais finansējums: 60 000,00 EUR

Projekta kopsavilkums:

Projekta mērķis ir pilnveidot digitālo platformu un nodrošināt standartizētu bioinformātikas darba plūsmu bērnu ļaundabīgo audzēju genoma sekvenēšanas datu uzglabāšanai, pirmapstrādei, interpretēšanai un ziņošanai, nodrošinot ātru piekļuvi dažāda līmeņa datu kopām un to integrāciju ar klīniskajiem datiem.

Informācija publicēta 29.10.2024.

Projekta progress 

2024. gada 1. oktorbis – 2025. gada 31. maijs

Projekta ietvaros ir izstrādāta darba plūsma somatisko un pārmantoto ģenētisko variāciju identificēšanai un interpretēšanai. Darba plūsma nodrošina viena nukleotīda variāciju, kopiju skaita izmaiņu, strukturālu variāciju un hibrīdgēnu identificēšanu un vizualizāciju, izmantojot brīvpieejas rīkus. Sadarbībā ar Bērnu klīniskās universitātes slimnīcu ir veikta darba plūsmas validācija. 

Informācija ievietota 30.05.2025.