Eiropas Savienības kohēzijas politikas programmas 2021.–2027. gadam 1.1.1. specifiskais atbalsta mērķis “Pētniecības un inovāciju kapacitātes stiprināšana un progresīvu tehnoloģiju ieviešana kopējā P&A sistēmā” 1.1.1.9. pasākums “Pēcdoktorantūras pētījumi”
Projekta nosaukums: Daudzziedu airenes raibuma vīrusa kodēto proteīnu strukturālie pētījumi
Projekta identifikācijas Nr.: 1.1.1.9/LZP/1/24/071
Projekta izpildes termiņš: 2025. gada 1. jūlijs – 2028. gada 30. jūnijs
Projekta finansējums: Pētniecības pieteikuma kopējās attiecināmās izmaksas ir 184 140,00 EUR no kurām 156 519,00 EUR ir Eiropas Reģionālās attīstības fonda finansējums.
Projekta zinātniskais vadītājs: PhD Jēkabs Fridmanis
Projekta kopsavilkums:
Pieteikto pētījumu plānots veikt Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā (BMC).
Ik gadu vīrusu izraisītas slimības rada ievērojamus kultūraugu ražas zudumus, kas savukārt veicina ekonomiskās attīstības stagnāciju. Neskatoties uz to, lielākā daļa augu vīrusu līdz šim ir vāji izpētīti un nav zināms to precīzs infekcijas mehānisms. Šī projekta mērķis ir veikt Sobemovīrusu ģints vīrusa, daudzziedu airenes raibuma vīrusa (RGMoV) strukturālos pētījumus kas ir zināms, spēj inficēt kulturaugus, tai skaitā kviešus (Triticum aestivum), miežus (Hordeum vulgare), un auzas (Avena sativa). Projekta ietvaros plānots noskaidrot RGMoV proteīnu lokalizāciju infekcijas laikā un pētīt vīrusa proteīnu mijiedarbību, izmantojot fluorescentās iezīmes augu protoplastu sistēmā un/vai in planta izmantojot vīrusa icDNS. Pēc mijiedarbības partneru noteikšanas projekta galvenā daļa fokusēsies uz vīrusa proteīnu un to kompleksu struktūru pētīšanu izmantojot trīs augstas izšķirtspējas strukturālās bioloģijas metodes – kodolu magnētisko rezonansi, kristalogrāfiju un krio-elektron mikroskopiju.
Izveidotais projekts, līdz ar mērķi izpētīt RGMoV vīrusa proteīnus un darbības mehāniku, atbilst RIS3 izvirzītajiem mērķiem izaugsmes veicināšanā, ar uzsvaru biomedicīnas, medicīnas tehnoloģijas, biofarmācijas un biotehnoloģijas specializācijā.
Lai gan mēs paredzam, ka projekta rezultāti nodrošinās vismaz divas, ja ne trīs publikācijas, lai mazinātu risku nesniegt solītos rezultātus un potenciāli saskarties ar pienākumu atmaksāt visu finansējumu, šajā projektā mēs nodrošinām, ka rezultāti tiks izplatīti, izmantojot vismaz vienu rakstu, kas iesniegts starptautiskā recenzētā žurnālā (Q1 vai Q2, Plos One, Plos Biology un PNAS utt.).
Projekta izpilde plānota 36 mēnešu laikā no 2025. gada 1. jūlija līdz 2028. gada 30. jūnijam.
Atslēgvārdi: Augu vīrusi, sobemovīrus, RGMoV, VPg, P16.
Informācija publicēta 01.07.2025.
Projekta progress:
- gada 1. jūlijs – 2025. gada 31. decembris
Projektā tika pārbaudīta RGMoV vīrusa spēja inficēt trīs dažādas auzu šķirnes. No inficētajiem augiem tika izdalīts liels daudzums pētāmā vīrusa, kura struktūra tika analizēta, izmantojot krioelektronmikroskopiju. Papildus tam no E. coli ekspresijas sistēmā tika iegūti atsevišķi RGMoV vīrusa proteīni, no kuriem daļai tika uzlabota ekspresija, izmantojot ģenētiskās manipulācijas. Daļu no šiem proteīniem tika mēģināts kristalizēt dažādos apstākļos.
Informācija publicēta 31.12.2025.