“Eksotiskā” mikrobioma un ar G-proteīnu saistīto receptoru funkcionālās izpētes grupa (D.Fridmaņa grupa)
Tā kā mūsu grupas dalībniekiem ir ievērojamas prasmes darbā ar dažādām molekulārās bioloģijas metodēm un liela pētnieciskā pieredze, tad gadu gaitā ir attīstījušies dažādi pētnieciskās darbības virzieni. Tomēr divi no tiem – mikrobioma izpēte un ar G-proteīnu saistīto receptoru (GPCR) funkcionālā izpēte dominē pār citiem. Mikrobioma jomā mēs veicam aktīvu izpēti tādas cilvēka ķermeņa vietas kā zarnas, sirds vārstules, asinis, rīkle, kuņģis un matu folikuli, savukārt GPCR pētījumi ir vērsti uz jaunu orfāno receptoru peptīdu ligandu meklējumiem, melanokortīna receptoru molekulārajiem pētījumiem un dažādu dzīvnieku sugu mazākuma alēļu kodēto melanokortīna receptoru funkcionālo raksturošanu. Kā arī, sadarbībā balstītu pētījumu ietvaros, mēs piedalāmies augsnes, vides, notekūdeņu, mikroplastmasas, kukaiņu zarnu, augu un sēklu mikrobioma pētījumos, kā arī veicam vietējo atgremotāju šķirņu un vistu vanaga (Accipiter gentilis) pilsētas populācijas ģenētisko raksturošanu.
Dāvids Fridmanis, PhD
Zinātniskās grupas vadītājs, vadošais pētnieks
Personāls
Dāvids Fridmanis, PhD, davids@biomed.lu.lv
Ineta Kalniņa, PhD, ineta.kalnina@biomed.lu.lv
Dita Gudrā, MSc. biol., dita.gudra@biomed.lu.lv
Ance Roga, MSc. biol., ance.roga@biomed.lu.lv
Edgars Liepa, MSc. biol., edgars.liepa@biomed.lu.lv
Edmunds Skinderskis, edmunds.skinderskis@biomed.lu.lv
Megija Lunģe, megija.lunge@biomed.lu.lv
Maija Ustinova, BSc. biol., maija.ustinova@biomed.lu.lv
Jomas sadarbības partneru meklēšanai
- Mikrobioma pētījumi
- Ar G-proteīnu saistīto receptoru pētījumi
- Dzīvnieku populācijas ģenētikas un genomikas pētījumi
10 reprezentatīvas publikācijas
- Bankina, B., Bimsteine, G., Paulovska, L., Paura, L., Pavlovica, O., Kaneps, J., Neusa-Luca, I., Roga, A. and Fridmanis, D. (2019). “Effects of soil tillage and crop rotation on the development of wheat stem base diseases.” Canadian Journal of Plant Pathology 41(3): 435-442, DOI: 10.1080/07060661.2019.1605409
- Gramatniece, A., Silamikelis, I., Zahare, I., Urtans, V., Zahare, I., Dimina, E., Saule, M., Balode, A., Radovica-Spalvina, I., Klovins, J., Fridmanis, D. and Dumpis, U. (2019). “Control of Acinetobacter baumannii outbreak in the neonatal intensive care unit in Latvia: whole-genome sequencing powered investigation and closure of the ward.” Antimicrob Resist Infect Control 8: 84, DOI: 10.1186/s13756-019-0537-z
- Gudra, D., Shoaie, S., Fridmanis, D., Klovins, J., Wefer, H., Silamikelis, I., Peculis, R., Kalnina, I., Elbere, I., Radovica-Spalvina, I., Hultcrantz, R., Skenders, G., Leja, M. and Engstrand, L. (2019). “A widely used sampling device in colorectal cancer screening programmes allows for large-scale microbiome studies.” Gut 68(9): 1723-1725, DOI: 10.1136/gutjnl-2018-316225
- Gudra, D., Pupola, D., Skenders, G., Leja, M., Radovica-Spalvina, I., Gorskis, H., Vangravs, R. and Fridmanis, D. (2020). “Lack of significant differences between gastrointestinal tract microbial population structure of Helicobacter pylori-infected subjects before and 2 years after a single eradication event.” Helicobacter 25(5): e12748, DOI: 10.1111/hel.12748
- Kalnins, M., Berzins, A., Gudra, D., Megnis, K., Fridmanis, D., Danilko, P. and Muter, O. (2020). “Selective enrichment of heterotrophic nitrifiers Alcaligenaceae and Alcanivorax spp. from industrial wastewaters.” AIMS Microbiol 6(1): 32-42. DOI: 10.3934/microbiol.2020002
- Lamsters, K., Ustinova, M., Birzniece, L., Silamiķelis, I., Gaidelene, J., Karušs, J., Krievāns, M., Kasparinskis, R., Fridmanis, D. and Muter, O. (2020). “Bacterial and archaeal community structure in benthic sediments from glacial lakes at the Múlajökull Glacier, central Iceland.” Polar Biology, DOI: 10.1007/s00300-020-02770-8
- Davids, M., Gudra, D., Radovica-Spalvina, I., Fridmanis, D., Bartkevics, V. and Muter, O. (2017). “The effects of ibuprofen on activated sludge: Shift in bacterial community structure and resistance to ciprofloxacin.” J Hazard Mater 340: 291-299, DOI: 10.1016/j.jhazmat.2017.06.065
- Fridmanis, D., Roga, A. and Klovins, J. (2017). “ACTH Receptor (MC2R) Specificity: What Do We Know About Underlying Molecular Mechanisms?” Front Endocrinol (Lausanne) 8(13): 13, DOI: 10.3389/fendo.2017.00013
- Krams, I. A., Kecko, S., Joers, P., Trakimas, G., Elferts, D., Krams, R., Luoto, S., Rantala, M. J., Inashkina, I., Gudra, D., Fridmanis, D., Contreras-Garduno, J., Grantina-Ievina, L. and Krama, T. (2017). “Microbiome symbionts and diet diversity incur costs on the immune system of insect larvae.” J Exp Biol, DOI: 10.1242/jeb.169227
- Muter, O., I, P., Selga, T., Berzins, A., Gudra, D., Radovica-Spalvina, I., Fridmanis, D. and Bartkevics, V. (2017). “Removal of pharmaceuticals from municipal wastewaters at laboratory scale by treatment with activated sludge and biostimulation.” Sci Total Environ 584-585: 402-413, DOI: 10.1016/j.scitotenv.2017.01.023