Ērču pārnēsāto patogēnu izpētes grupa (K.Branguļa grupa)
Mūsu pētniecības virziens galvenokārt koncentrējas uz Laima slimības (Laima boreliozes) ierosinātāja Borrelia burgdorferi proteīnu strukturālajiem un funkcionālajiem pētījumiem. B. burgdorferi, salīdzinot ar citām baktērijām, kodē netipiski daudz lipoproteīnus. Ir identificēti vairāk nekā 140 dažādi lipoproteīni, kas piestiprināti pie iekšējās vai ārējās membrānas lipīdiem ar N-terminālo daļu. Pie tam, liela daļa no lipoproteīniem ir novietoti uz ārējās virsmas. Lai arī ir pētījumi, kas norāda uz šo proteīnu būtisko lomu Laima slimības patoģenēzē, joprojām ir maz datu par lipoproteīnu mijeidarbības partneriem (ligandiem, receptoriem). Izmantojot rentgenstaru kristalogrāfiju, mūsu mērķis ir noteikt Laima slimības patoģenēzē svarīgo proteīnu 3D struktūras, kā arī proteīnu-proteīnu un proteīnu-ligandu kompleksu 3D struktūras. Savienojot šo strukturālo informāciju ar funkcionālajiem pētījumiem, mēs vēlamies paplašināt izpratni par molekulārajiem mehānismiem, ko B. burgdorferi pielieto, lai rezultātā ierosinātu saslimšanu. Iegūtās zināšanas potenciāli var palīdzēt izstrādāt jaunu stratēģiju cīņā pret Laima slimību.
Kalvis Brangulis, PhD
Zinātniskās grupas vadītājs, vadošais pētnieks
Personāls
Kalvis Brangulis, PhD, kalvis@biomed.lu.lv
Everita Elīna Siņicina, BSc, everita.elina@biomed.lu.lv
Dagnija Tupiņa, dagnija.tupina@biomed.lu.lv
Jomas sadarbības partneru meklēšanai
- Laima slimības ierosinātāja proteīnu strukturālie un funkcionālie pētījumi
- Citu ar ērču pārnēsāto patogēnu saistīto proteīnu strukturālie un funkcionālie pētījumi
10 reprezentatīvas publikācijas
- Brangulis K, Surth V, Marcinkiewicz AL, Akopjana I, Kazaks A, Bogans J, Huber A, Lin YP, Kraiczy P: CspZ variant-specific interaction with factor H incorporates a metal site to support Lyme borreliae complement evasion. J Biol Chem 2025, 301(1):108083. DOI: 10.1016/j.jbc.2024.108083
- Norris SJ, Brangulis K: Meta-analysis of the Vmp-like sequences of Lyme disease Borrelia: evidence for the evolution of an elaborate antigenic variation system. Front Microbiol 2024, 15:1469411. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.
2024.1469411 - Brangulis K, Akopjana I, Drunka L, Matisone S, Zelencova-Gopejenko D, Bhattacharya S, Bogans J, Tars K: Members of the paralogous gene family 12 from the Lyme disease agent Borrelia burgdorferi are non-specific DNA-binding proteins. PLoS One 2024, 19(4):e0296127. DOI: https://doi.org/10.1371/
journal.pone.0296127 - Brangulis, K.; Akopjana, I.; Bogans, J.; Kazaks, A.; Tars, K., Structural studies of chromosomally encoded outer surface lipoprotein BB0158 from Borrelia burgdorferi sensu stricto. Ticks Tick Borne Dis 2024, 15, (1), 102287. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2023.102287
- Brangulis, K.; Drunka, L.; Akopjana, I.; Tars, K., Structure of the Borrelia burgdorferi ATP-dependent metalloprotease FtsH in its functionally relevant hexameric form. Biochim Biophys Acta Proteins Proteom 2024, 1872, (1), 140969. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2023.140969
- Foor, S. D.; Brangulis, K.; Shakya, A. K.; Rana, V. S.; Bista, S.; Kitsou, C.; Ronzetti, M.; Alreja, A. B.; Linden, S. B.; Altieri, A. S.; Baljinnyam, B.; Akopjana, I.; Nelson, D. C.; Simeonov, A.; Herzberg, O.; Caimano, M. J.; Pal, U., A unique borrelial protein facilitates microbial immune evasion. mBio 2023, 14, (5), e0213523. DOI: https://doi.org/10.1128/mbio.02135-23
- Marcinkiewicz, A. L.; Brangulis, K.; Dupuis, A. P., 2nd; Hart, T. M.; Zamba-Campero, M.; Nowak, T. A.; Stout, J. L.; Akopjana, I.; Kazaks, A.; Bogans, J.; Ciota, A. T.; Kraiczy, P.; Kolokotronis, S. O.; Lin, Y. P., Structural evolution of an immune evasion determinant shapes pathogen host tropism. Proc Natl Acad Sci U S A 2023, 120, (27), e2301549120. DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2301549120
- Akopjana, I.; Brangulis, K., Structural Analysis of the Outer Membrane Lipoprotein BBA14 (OrfD) and the Corresponding Paralogous Gene Family 143 (PFam143) from Borrelia burgdorferi. Pathogens 2022, 11, (2). DOI: https://doi.org/10.3390/pathogens11020154
- Brangulis, K.; Akopjana, I.; Petrovskis, I.; Kazaks, A.; Tars, K., Structural analysis of the outer surface proteins from Borrelia burgdorferi paralogous gene family 54 that are thought to be the key players in the pathogenesis of Lyme disease. J Struct Biol 2020, 210, (2), 107490. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jsb.2020.107490
- Brangulis, K.; Akopjana, I.; Petrovskis, I.; Kazaks, A.; Zelencova, D.; Jekabsons, A.; Jaudzems, K.; Tars, K., BBE31 from the Lyme disease agent Borrelia burgdorferi, known to play an important role in successful colonization of the mammalian host, shows the ability to bind glutathione. Biochim Biophys Acta Gen Subj 2020, 1864, (3), 129499. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbagen.2019.129499