Molekulārās un funkcionālās genomikas izpētes grupa (V.Rovītes grupa)
Mūsu pētnieciskās grupas darbības mērķis ir atklāt molekulāros marķierus un mehānismus kas ietekmē cilvēka slimību attīstību un progresiju, lai atklātu potenciālus mērķa marķierus, kas uzlabotu diagnostiku, prognostiku un slimību ārstēšanu. Mūsu grupas veiktie pētījumi pilnībā izmanto ciešo saikni ar nacionālo biobanku – Valsts iedzīvotāju genoma datubāzi, Genoma centra sekvencēšanas centru un sadarbību ar lielākajām slimnīcām un medicīnas iestādēm, kas ļauj mums veikt pilnu pētījumu ciklu no pacientu atvasinātu paraugu vākšanas līdz lielmolekulārai analīzei, funkcionāliem pētījumiem un galīgajai datu interpretācijai. Galvenie projekti mūsu grupā ir saistīti ar jaunu audzēju molekulāro marķieru atklāšanu un vēža attīstības mehānismu izpēti, lai atrastu prognostiskus faktorus vai uzlabotu terapiju. Pašlaik, mūsu grupa īsteno projektus gastrointestinālo un smadzeņu audzēju, kā arī endokrīnās sistēmas audzēju izpētes jomā, kā arī autoimūno slimību pētniecībā. Pašlaik, mūsu komanda veic jaunu nākamās paaudzes sekvencēšanas metožu izstrādes un attīsta pieredzi funkcionālos pētījumos, lai varētu īstenot mūsdienīgus pētījumus translācijas medicīnas jomā. Savos pētījumos esam pirmie, kas aprobējuši vienas šūnas sekvencēšanas un telpiskās transkriptomikas metodes Latvijā.
Vita Rovīte, PhD
Zinātniskās grupas vadītāja, vadošā pētniece
Personāls
Vita Rovīte, PhD, vita.rovite@biomed.lu.lv
Raitis Pečulis, PhD, raitis@biomed.lu.lv
Ilona Mandrika, MSc. biol., ilona@biomed.lu.lv
Helvijs Niedra, MSc. biol., helvijs.niedra@biomed.lu.lv
Marta Līva Spriņģe, marta.springe@biomed.lu.lv
Rihards Saksis, MSc. biol., rihards.saksis@biomed.lu.lv
Marija Simona Dombrovska, marija.dombrovska@biomed.lu.lv
Violeta Lisovska, violeta.lisovska@biomed.lu.lv
Daniels Pugačevskis, daniels.pugacevskis@biomed.lu.lv
Katrīna Anna Tiltiņa, katrina.tiltina@biomed.lu.lv
Marta Zamarīte, marta.zamarite@biomed.lu.lv
Jomas sadarbības partneru meklēšanai
- Funkcionālie šūnu modeļi
- Gastrointestinālie un smadzeņu audzēji un endokrīnās sistēmas audzēji
- Autoimūnās slimības
- Jaunākās sekvencēšanas tehnoloģijas, omics metodes un tehnoloģijas
10 reprezentatīvas publikācijas
- Helvijs Niedra, Raitis Peculis, Rihards Saksis, Ilona Mandrika, Sofija Vilisova, Jurijs Nazarovs, Austra Breiksa, Aija Gerina, Julie Earl, Ignacio Ruz-Caracuel, Marta Gabriela Rosas, Aldis Pukitis, Natalja Senterjakova, Vita Rovite. Tumor and α-SMA-expressing stromal cells in pancreatic neuroendocrine tumors have a distinct RNA profile depending on tumor grade. Mol Oncol. 2025 Mar;19(3):659-681.
- Helvijs Niedra, Olesja Rogoza, Rihards Saksis, Raitis Peculis, Anzela Halilova, Aija Gerina, Sofija Vilisova, Natalja Senterjakova, Aldis Pukitis, Ignacio Ruz-Caracuel, Julie Earl, Georgina Kolnikova, Peter Dubovan, Miroslav Tomas, Peter Makovicky, Maria Urbanova, Bozena Smolkova, Eythimios Koniaris, Ioanna Aggelioudaki, Agapi Kataki, Vita Rovite. Transcriptomic profiling of pancreatic neuroendocrine tumors: dysregulation of WNT, MAPK, PI3K, neddylation pathways and potential non-invasive biomarkers. PLoS One. 2025 Jun 16;20(6):e0325672.
- Maria Urbanova, Fabrice Viol, Laura Ruiz-Cañas, Efthymios Koniaris, Rihards Saksis, Sandra Batres-Ramos, Julie Earl, Agapi Kataki, Verona Buocikova, Monika Burikova, Marina Cihova, Lucia Rojikova, Peter Makovicky, Miroslava Matuskova, Yvonne Kohl, Andrea Riedmayer, Marianna Makova, Ladislav Baciak, Daniel Gogola, Olesja Rogoza, Vita Rovite, Bruno Sainz Jr, Bozena Smolkova, Joerg Schrader. Aurora kinase A inhibition as a synthetic lethality strategy in ARID1A-mutated gastroenteropancreatic neuroendocrine carcinoma. Cancer Lett. 2025 Dec 1:634:218033.
- Kristīne Vaivode, Rihards Saksis, Helēna Daiga Litvina, Helvijs Niedra, Marta Līva Spriņģe, Una Krūmiņa, Jānis Kloviņš, Vita Rovite. Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alterations in Patient Immune Cells with Pulmonary Long COVID-19 Complications. Curr Issues Mol Biol. 2024 Jan 2;46(1):461-468.
- Saksis R, Silamikelis I, Laksa P, Megnis K, Peculis R, Mandrika I, Rogoza O, Petrovska R, Balcere I, Konrade I, Steina L, Stukens J, Breiksa A, Nazarovs J, Sokolovska J, Pirags V, Klovins J, Rovite V. Medication for Acromegaly Reduces Expression of MUC16, MACC1 and GRHL2 in Pituitary Neuroendocrine Tumour Tissue. Frontiers in Oncology. 2021 Feb. doi:10.3389/fonc.2020.593760
- Rogoza O, Megnis K, Kudrjavceva M, Gerina-Berzina A, Rovite V. Role of Somatostatin Signalling in Neuroendocrine Tumours. Int J Mol Sci. 2022 Jan. doi:10.3390/ijms23031447
- Rihards Saksis, Olesja Rogoza, Helvijs Niedra, Kaspars Megnis, Ilona Mandrika, Inga Balcere, Liva Steina, Janis Stukens, Austra Breiksa, Jurijs Nazarovs, Jelizaveta Sokolovska, Ilze Konrade, Raitis Peculis, Vita Rovite. Transcriptome of GH-producing pituitary neuroendocrine tumours and models are significantly affected by somatostatin analogues. Cancer Cell Int. 2023 Feb. doi:10.1186/s12935-023-02863-4
- Niedra H, Peculis R, Litvina HD, Megnis K, Mandrika I, Balcere I, Romanovs M, Steina L, Stukens J, Breiksa A, Nazarovs J, Sokolovska J, Liutkeviciene R, Vilkevicute A, Konrade I, Rovite V. Genome wide analysis of circulating miRNAs in growth hormone secreting pituitary neuroendocrine tumor patients’ plasma. Front Oncol. 2022 Sep 9;12:894317. doi: 10.3389/fonc.2022.894317
- Niedra H, Konrade I, Peculis R, Isajevs S, Saksis R, Skapars R, Sivins A, Daukste BE, Mezaka D, Rovite V. Solitary fibrous tumor with IGF-II-induced non-islet cell tumor hypoglycemia: a case report and molecular characterization by next-generation sequencing. Front Oncol. 2023 Jul 4;13:1188579. doi: 10.3389/fonc.2023.1188579
- Bozena Smolkova, Agapi Kataki, Julie Earl, Ignacio Ruz-Caracuel, Marina Cihova, Maria Urbanova, Verona Buocikova, Sandra Tamargo, Vita Rovite, Helvijs Niedra, Joerg Schrader, Yvonne Kohl. Liquid biopsy and preclinical tools for advancing diagnosis and treatment of patients with pancreatic neuroendocrine neoplasms. Crit Rev Oncol Hematol. 2022 Dec:180:103865.