Precīzijas medicīnas grupa (J.Kloviņa grupa)
Mūsu grupas mērķis ir veikt pētījumus kas vērsti uz precīzijas un personalizētās medicīnas attīstību. Mēs pielietojam vismodernākās lielapjoma molekulāro un klīnisko datu analīzes tehnoloģijas, lai izprastu mehānismus, kas veicina slimību attīstību un ietekmē medikamentu darbību. Mūsu galvenais uzsvars pētniecībā ir metabolās un ar zarnu traktu saistītās slimības, īpašu uzmanību pievēršot procesiem, kurus ietekmē mikrobioms. Veicot pētījumus, mēs izmantojam unikālos resursus, ko sniedz LBMC pārraudzībā esošā biobanka (Valsts iedzīvotāju genoma datubāze). Ciešā sadarbībā ar slimnīcām un ārstiem mēs veicam longitudinālus klīniskos pētījumus ar rūpīgi atlasītām veselo brīvprātīgo vai pacientu grupām, iegūstot dažādus bioloģiskos paraugus un plašu, detalizētu fenotipisko informāciju. Mūsu galvenie sasniegumi ir saistīti ar otrā tipa cukura diabēta medikamentu darbības izpēti ne tikai cilvēkos, bet arī dzīvnieku modeļos. Mūsu pētījumi ir atklājuši dažādus ģenētiskos un ar mikrobiomu saistītos faktorus, kas ietekmē visplašāk diabēta terapijā lietotā medikamenta metformīna efektivitāti un blakņu izpausmes. Mūsu grupas tālejošais mērķis ir identificēt cēloņsakarības mijiedarbībā starp saimniekorganismu un mikrobiomu gan veselā organismā, gan dažādās slimībās un izmantot šo informāciju preventīvās un personalizētās medicīnas ieviešanā. Mūsu grupa plaši sadarbojas ar medicīnas pētniekiem Latvijā, veicinot precīzijas medicīnu Latvijā, ieskaitot pētījumus par COVID-19.
Jānis Kloviņš, PhD
Zinātniskās grupas vadītājs, vadošais pētnieks
Personāls
Jānis Kloviņš, PhD, prof., klovins@biomed.lu.lv
Monta Brīvība, PhD, monta.briviba@biomed.lu.lv
Ilze Elbere, PhD, ilze.elbere@biomed.lu.lv
Laila Silamiķele, PhD, laila.silamikele@biomed.lu.lv
Agnese Viļuma, PhD, agnese.viluma@biomed.lu.lv
Ivars Silamiķelis, MSc. biol., ivars.silamikelis@biomed.lu.lv
Laura Ansone, MSc. biol., laura.ansone@biomed.lu.lv
Maija Rozenberga, MSc. biol., maija.rozenberga@biomed.lu.lv
Raimonds Resčenko, MSc.biol., raimonds.rescenko@biomed.lu.lv
Līga Birzniece, BSc. biol., liga.birzniece@biomed.lu.lv
Ivanna Atava, ivanna.atava@biomed.lu.lv
Lauma Jagare, lauma.jagare@biomed.lu.lv
Daniella Borisova, daniella.borisova@biomed.lu.lv
Laura Bunka, laura.bunka@biomed.lu.lv
Līva Pelcmane, liva.pelcmane@biomed.lu.lv
Justīne Puriņa, justine.purina@biomed.lu.lv
Jomas sadarbības partneru meklēšanai
- Mikrobioma un citu lielapjoma datu virzītā metabolo un gastrointestinālo slimību izpēte
- Mikrobioms un dzīvesstila faktori
- Biomarķieu analīzē bāzētu personalizētu pieeju izstrāde slimību pevencijai un ārstēšanai
10 reprezentatīvas publikācijas
- Elbere I, Silamikelis I, Dindune II, Kalnina I, Ustinova M, Zaharenko L, Silamikele L, Rovite V, Gudra D, Konrade I, Pirags V, Klovins J. Baseline gut microbiome composition predicts metformin therapy short-term efficacy in newly diagnosed type 2 diabetes patients. PLoS One. 2020;15(10 October).
- Ustinova M, Ansone L, Silamikelis I, Rovite V, Elbere I, Silamikele L, Kalnina I, Fridmanis D, Sokolovska J, Konrade I, Pirags V, Klovins J. Whole-blood transcriptome profiling reveals signatures of metformin and its therapeutic response. PLoS One. 2020;15(8 August).
- García-Calzón S, Perfilyev A, Martinell M, Ustinova M, Kalamajski S, Franks PW, Bacos K, Elbere I, Pihlajamäki J, Volkov P, Ahlqvist E, Ling C. Epigenetic markers associated with metformin response and intolerance in drug-naïve patients with type 2 diabetes. Sci Transl Med. 2020;12(561).
- Ustinova M, Silamikelis I, Kalnina I, Ansone L, Rovite V, Elbere I, Radovica-Spalvina I, Fridmanis D, Aladyeva J, Konrade I, Pirags V, Klovins J. Metformin strongly affects transcriptome of peripheral blood cells in healthy individuals. PLoS One. 2019;14(11).
- Elbere I, Silamikelis I, Ustinova M, Kalnina I, Zaharenko L, Peculis R, Konrade I, Ciuculete DM, Zhukovsky C, Gudra D, Schiöth HB, Klovins J. Significantly altered peripheral blood cell DNA methylation profile as a result of immediate effect of metformin use in healthy individuals. Clin Epigenetics. 2018;10(1).
- Elbere I, Kalnina I, Silamikelis I, Konrade I, Zaharenko L, Sekace K, Radovica-Spalvina I, Fridmanis D, Gudra D, Pirags V, Pirags V, Klovins J. Association of metformin administration with gut microbiome dysbiosis in healthy volunteers. PLoS One. 2018;13(9).
- Mandrika I, Tilgase A, Petrovska R, Klovins J. Hydroxycarboxylic acid receptor ligands modulate proinflammatory cytokine expression in human macrophages and adipocytes without affecting adipose differentiation. Biol Pharm Bull. 2018;41(10):1574–80.
- Rovite V, Wolff-Sagi Y, Zaharenko L, Nikitina-Zake L, Grens E, Klovins J. Genome database of the latvian population (LGDB): Design, goals, and primary results. J Epidemiol. 2018;28(8):353–60.
- Zaharenko L, Kalnina I, Geldnere K, Konrade I, Grinberga S, Židzik J, Javorský M, Lejnieks A, Nikitina-Zake L, Fridmanis D, Pirags V, Klovins J. Single nucleotide polymorphisms in the intergenic region between metformin transporter OCT2 and OCT3 coding genes are associated with short-Term response to metformin monotherapy in type 2 diabetes mellitus patients. Eur J Endocrinol. 2016;175(6):531–40.
- Zhou K, Yee SW, Seiser EL, Van Leeuwen N, Tavendale R, Bennett AJ, Groves CJ, Coleman RL, Van Der Heijden AA, Beulens JW, Giacomini KM, Pearson ER. Variation in the glucose transporter gene SLC2A2 is associated with glycemic response to metformin. Nat Genet. 2016;48(9):1055–9