Mikrobioloģiskais atbalsts rekombinanto proteīnu ekspresijai

Piekļuve piemērotu ekspresijas organismu šūnu bankām, ražošanas apstākļu optimizācija un dažādu attīrīšanas protokolu izstrāde rekombinanto proteīnu iegūšanai. Proteīnu un vīrusiem līdzīgu daļiņu (VLP) ražošanai izmantotojot dažādas E. coli un raugu ekspresijas sistēmas.

Baktēriju un raugu šūnu audzēšanai kontrolētos apstākļos kolbās tiek izmantoti trīs plauktu kratītāji-inkubatori Multitron II. Barotņu sterilizācijai tiek izmantoti autoklāvi Systec V-150.

Bioreaktoru atbalsts

E.coli un raugu lielapjoma kultivēšanai ir pieejami dubultais 1 L EDF 1.1., 5 L BIO4 un 20 L BioFlo 410 fermentori/bioreaktori.

Biomasas savākšana un dezintegrācija

Analītiskiem nolūkiem biomasa tiek savākta, izmantojot Eppendorf analītiskās centrifūgas. Lielākiem apjomiem ir pieejamas Beckman J2-21 un AVANTI J-301 (Beckman Coulter, ASV), kā arī Eppendorf 5810 R centrifūgas.

Biomasas dezintegrācijai gan analītiskā, gan preparatīvā mērogā ir pieejami ultraskaņas dezintegratori Soniprep 150, UD-20 un UP200S, Microfluidizer LM 20, kā arī nepārtrauktas plūsmas šūnu dezintegrators CF1.

Proteīnu attīrīšana ar hromatogrāfiju

Laboratorijas mēroga proteīnu attīrīšanai ir pieejamas hromatogrāfijas sistēmas ÄKTA prime plus, ÄKTA Avant (ar programmatūru Unicorn 6.2) un ÄKTA pure (GE Healthcare). Darbam ar termolabiliem proteīniem ir pieejama Unichromat 1500 iekārta.

Atkarībā no proteīna tiek izmantotas dažādas attīrīšanas stratēģijas: gēla filtrācija uz Sepharose CL2B, 4B, 6B, 4FF, 6FF, Superose 6, Superdex 75 un Superdex 200 nesējiem; jonu apmaiņas hromatogrāfija, izmantojot Sepharose Q HP, Fractogel DEW, Source 15Q, kā arī katjonītus Sepharose SP HP un Source 15SP. His-tag proteīniem tiek izmantota imobilizētas metāla afinitātes hromatogrāfija (IMAC). Īpašos gadījumos var tikt izstrādāti kompleksāki attīrīšanas protokoli, izmantojot hidrofobās mijiedarbības hromatogrāfiju (HIC), reversās fāzes hromatogrāfiju (PharmPrep HP 100 RP-18 un Lichroprep RP-18, 25–40 μm), kā arī multimodulārus hromatogrāfijas nesējus (hidroksiapatītu).

Ultracentrifugācija

Vīrusu un nanodaļiņu attīrīšanai ar sedimentācijas metodēm ir pieejamas divas ultracentrifūgas L-100XP.

Procesu kontrole un produktu raksturošana

Attīrīšanas procesu kontrolei un attīrīto produktu raksturošanai tiek izmantota modulāra analītiskā HPLC sistēma Prominence LC20 (Shimadzu, ASV). Daļiņu izmēra un proteīnu homogenitātes novērtēšanai tiek veikti dinamiskās gaismas izkliedes (DLS) mērījumi, izmantojot Malvern Zetasizer Nano ZS iekārtu (Malvern Instruments, Lielbritānija).

Augu laboratorija

Augu audzēšanas un transfekcijas eksperimentiem ir pieejamas augu augšanas kameras MLR-351H un LGC300C, mikrobioloģiskās drošības skapis KR-130, Helios Gene Gun un Tubing Prep Station.

Anaerobā laboratorija

Eksperimentiem, kuriem nepieciešami anaerobie apstākļi, ir pieejama PLAS LABS 855 anaerobā kamera.