Pētījumi Virzieni un grupas

D. Pjanovas grupa

Pētniecība

Vēža šūnu bioloģijas un melanomas izpētes grupa izveidojās apvienojoties divām grupām ar pieredzi vēža šūnu bioloģijā (vadītājs Dr. habil. Med. Jekaterina Ērenpreisa) un melanomas izpētē (vadītājs Dr. biol. Dace Pjanova). Grupa izveidota ar mērķi fokusēties uz fundamentālām problēmām vēža šūnu bioloģijā, kā arī iespējām jaunās zināšanas pārnest uz klīnisko praksi.

Pašlaik grupas prioritāte ir meklēt vēža šūnu īpašības, kas saistītas ar rezistenci pret terapiju neatkarīgi no terapijas veida (genotoksiskā iedarbība, mērķētā terapija), fokusējoties uz “vēža šūnas cikla izpēti” (1. attēls), kas sastāv no poliploidizācijas (šūnas genoma pavairošanās vienas šūnas ietvaros) un turpmākiem de-poliploidizācijas cikliem, kā rezultātā rodas vēža cilmes šūnu paaudze, kas atjauno audzēju, kā arī procesiem, kas saistīti ar mejotisku un agrīnas embrioģenēzes gēnu izpaušanos, paralēli meklējot saistītās ģenētiskās un epiģenētiskās izmaiņas vēža šūnās.

 

 

1. attēls. Raksta Salmina et al. “The cancer aneuploidy paradox: In the light of evolution”, Genes (Basel), 2019. Jan 25;10(2) grafiskais kopsavilkums. pii: E83. doi: 10.3390/genes10020083.

Papildus grupa ir iesaistīta tādos pētījumos kā iedzimtās imunitātes lomas izpēte vēža imūnterapijas efektivitātē, šūnas kodola strukturālo izmaiņu regulācijas izpētē pēc audzēja šūnu diferencēšanās inducēšanas un augsta, vidēja līdz zema riska melanomas jutības gēnu un iedzimtu gēnu variāciju identificēšanā, kas varētu prognozēt slimības gaitu un terapijas iznākumu.

Vēsturiski vēža šūnu bioloģijas laboratoriju dibināja prof. Jānis Oļģerts Ērenpreiss (1929-1996). https://www.researchgate.net/publication/329547152_Janis_Olgerts_Erenpreiss_and_His_Theory_of_Carcinogenesis.

Prof. Jānis Oļģerts Ērenpreiss, Dr. habil. med, bija teorētiķis un eksperimentētājs šūnu kodola struktūras izpētē un kanceroģenēzē. Viņš sarakstīja vairākas grāmatas par vēzi. Pēdējā viņa grāmata “Current Concepts of Malignant Growth. Part A. From a Normal Cell to Cancer” tika nopublicēta 1993. gadā. Jānis plānoja uzrakstīt arī B daļu “From Cancer to the Normal Cell”, taču devās aizsaulē. Viņš bija lietpratējs 19.gs lielāko zinātnieku aizsāktā tēmā par vēža šūnas embrionālo dabu. Viņš mēdza teikt: “Vēža veidošanās laikā nenotiek nekas cits kā embriolizācija”.

Šobrīd, kad vēža šūnas līdzība embrionālām šūnām ir kļuvusi acīmredzama, Jāņa Ērenpreisa monogrāfija daudzos aspektos ir kļuvis ļoti aktuāla. Ar Jekaterinas Ērenpreisas gādību un izdevniecības "Zvaigzne" atļauju tā ir pieejama elektroniskā formā šeit.

   J Ērenpreiss. Current Concepts of Malignant Growth. Part A. From a Normal Cell to Cancer

Zinātniskais personāls

Sadarbības partneri

Starptautiskie:

 GenoMEL/BioGenoMEL – melanomas ģenētikas konsorciji

Prof. Mark S Cragg, Sauthemptonas Universitāte, Lielbritānija – vēža šūnu bioloģija

Dr. Thomas R Jackson, Mančestras Universitāte, Lielbritānija – vēža šūnu novecošanās

Prof. Michael Hausmann – Heidelbergas Universitāte, Vācija – superrezolūcijas mikroskopija, hromatīna organizācija

Prof. Alessandro Giuliani, Ist. Super. di Sanita, Roma, Itālija – sistēmbioloģija, statistika

Dr. Masa Tchuchiya, Keio University (Tsuruoka), Japāna - sistēmbioloģija

Prof. Kenichi Yoshikawa, Doshisha University (Kyotanabe), Japāna – hromatīna biofizika

Dr. Alesandrs Vinogradovs un Dr. Olga Anatskaya – Citoloģijas Institūts, Sant-Pēterburga, Krievija – poliploīdijas transkriptoms

Dr. Vita Pašukiene, Nacionālais Vēža institūts, Lietuva – audzēju imūnterapija un adjuvanti

Prof. Yi-Ling Lin, Akadēmija Sinica, Taivāna – dsRNS antivirusālās īpašības Dr. Christine E. Engeland, Heidelbergas Universitāte, Vācija – audzēju imūnterapija

Nacionālie:

 Prof. Dr. med. Simona Doniņa, Rīgas Austrumu Klīniskā Universitātes slimnīca – audzēju imunoloģija

Prof. Dr. med. Sergejs Isajevs, Rīgas Austrumu Klīniskā Universitātes slimnīca, Patoloģijas centrs – melanomas patoloģija

Prof. Dr. chem. Jeļena Kirilova, Daugavpils Universitāte – fluorescentās zondes

Dr. Guna Feldmane, SIA “Larifan” - imūmmodulācija

Dr. phys. Tālivaldis Freivalds, Latvijas Universitāte – hromatīna struktūra

Dr. med. Juris Ērenpreiss, Rīga Stradiņa Universitāte - speratoģenēze

Dr. biol. Inna Inaškina grupa, BMC – molekulārā ģenētika

 

Publikācijas

• Starptautiskas

• The cancer aneuploidy paradox: In the light of evolution K Salmiņa, Huna, A., Kalejs, M.,, D Pjanova, Scherthan, H., Cragg, M.S.,, J Ērenpreisa , Genes, 10 (2), art. no. 83. PMID: 30691027 , 2019
• Oncolytic viruses sensitize human tumor cells for NY-ESO-1 tumor antigen recognition by CD4+ effector T cells Delaunay, T., Violland, M., Boisgerault, N., Dutoit, S., Vignard, V., Münz, C., Gannage, M., Dréno, B., Vaivode, K.,, D Pjanova, Labarrière, N., Wang, Y., Chiocca, E.A., Boeuf, F.L., Bell, J.C., Erbs, P., Tangy, F., Grégoire, M., , OncoImmunology, 7 (3), art. no. e1407897. PMID: 29399408 , 2018
• Differential staining of peripheral nuclear chromatin with Acridine orange implies an A-form epichromatin conformation of the DNA J Ērenpreisa, J Krigerts, K Salmiņa, Selga T, Sorokins H, Freivalds T. , Nucleus. Jan 1;9(1):171-181. doi: 10.1080/19491034.2018.1431081. PMID: 29363398 , 2018
• DNA methylation of the Oct4A enhancers in embryonal carcinoma cells after etoposide treatment is associated with alternative splicing and altered pluripotency in reversibly senescent cells. Baryshev M, I Iņaškina, K Salmiņa, A Hūna, Jackson TR, J Ērenpreisa , Cell Cycle, Mar 19:1-5. doi: 10.1080/15384101.2018.1426412. [Epub ahead of print] PMID: 29372665 , 2018
• Association of the 16q24.3 region gene variants rs1805007 and rs4785763 with heightened risk of melanoma in Latvian population A Ozola, Ruklisa, D., D Pjanova , Meta Gene, 18, pp. 87-92. , 2018
• Telomere length and survival in primary cutaneous melanoma patients Rachakonda, S., Srinivas, N., Mahmoudpour, S.H., Garcia-Casado, Z., Requena, C., Traves, V., Soriano, V., Cardelli, M.,, D Pjanova, Molven, A., Gruis, N., Nagore, E., Kumar, R , Scientific Reports, 8 (1), art. no. 10947. PMID: 30026606 , 2018
• Stress-induced polyploidy shifts somatic cells towards a pro-tumourogenic unicellular gene transcription network . J Ērenpreisa, Giuliani A, Vinogradov AE, Anatskaya OV, Vazquez-Martin A,, K Salmiņa, Cragg MS , Cancer Hypotheses 2018, 1, 1, 1-20. , 2018
• Polyploidy activates biological pathways related to morphogenesis in mammalian tissues. Mini-review. 2. Anatskaya OV,, J Ērenpreisa, K Salmiņa, Vazquez- Martin A, Huna A, Nikolsky NN, Vinogradov AE , MOJ Immunol. - MedCrave 2018;6:90‒93 , 2018
• Nucleolar aggresomes mediate release of pericentric heterochromatin and nuclear destruction of genotoxically treated cancer cells K Salmiņa, A Hūna, I Iņaškina, Belyayev, A., J Krigerts, Pastova, L., Vazquez-Martin, A.,, J Ērenpreisa , Nucleus, 8 (2), pp. 205-221 , 2017
• Germline variation at CDKN2A and associations with nevus phenotypes among members of melanoma families Taylor NJ, Mitra N, Goldstein AM, Tucker MA, Avril MF, Azizi E, Bergman W, Bishop DT, Bressac-de Paillerets B, Bruno W, Calista D, Cannon-Albright LA, Cuellar F, Cust AE, Demenais F, Elder DE, Gerdes AM, Ghiorzo P, Grazziotin TC, Hansson J, Harland M, Hay, D Pjanova, Pritchard A, Puig S, van der Stoep N, Wadt KAW, Whitaker L, Yang XR, Newton Bishop JA, Gruis NA, Kanetsky PA; GenoMEL Study Group , Journal of Investigative Dermatology, 137 (12), pp. 2606-2612 , 2017
• Chapter 12 - Survival at the Brink: Chromatin Autophagy of Tumor Cells in Response to Genotoxic Challenge J Ērenpreisa, K Salmiņa, Belyayev A.,, I Iņaškina, Cragg M.S. , Autophagy: Cancer, Other Pathologies, Inflammation, Immunity, Infection, and Aging, edited by M.A. Hayat,, Elsevier Academic Press, Pages 275-294., ISBN 9780128121467, https://doi.org/10.1016/B978-0-12-812146-7.00012-3 , 2017
• Chapter 4 - Accelerated Senescence of Cancer Stem Cells: A Failure to Thrive or a Route to Survival? J Ērenpreisa, K Salmiņa, Cragg M , Senescence - Physiology or Pathology, Edited by Jolanta Dorszewska and Wojciech Kozubski, InTech, ISBN 978-953-51-3461-9 , 2017
• Disentangling the aneuploidy and senescence paradoxes: a study of triploid breast cancers non-responsive to neoadjuvant therapy Gerashchenko, B.I., K Salmiņa, Eglitis, J., A Hūna, Grjunberga, V., J Ērenpreisa , Histochemistry and Cell Biology, 145 (4), pp. 497-508 , 2016
• Erratum to: Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition) Klionsky, D.J., …, J Ērenpreisa, ... Deter, R.L. , Autophagy, 12 (2), p. 443 , 2016
• Somatic polyploidy is associated with the upregulation of c-MYC interacting genes and EMT-like signature Vazquez-Martin, A., Anatskaya, O., Giuliani, A., J Ērenpreisa, Huang, S., K Salmiņa, I Iņaškina, A Hūna, Nikolsky, N., Vinogradov, A. , Oncotarget, 7(46), 75235-75260 , 2016

• Vietēja mēroga

• Cancer is ontogenetically pre-programmed. J Ērenpreisa , MEDIC, 22(2): 24-27 , 2014
• Low-penetrance melanoma risk gene polymorphisms in Latvian population. A Ozola, Baginskis A, Azarjana K, Doniņa S, Proboka G, Čēma I, O Heisele, Eņģele L, Štreinerte B, D Pjanova , Environmental and Experimental Biology, 12: 55–56 , 2014
• Galvas un kakla lokalizācijas melanomas raksturojums Latvijas populācijā (1998-2007) Ķempele A, Azarjana K, Čēma I, D Pjanova, Rivošs A , RSU Zinātniskie raksti, 1:313-319. , 2010
• Ļaundabīgās melanomas jutības gēni Azarjana K, D Pjanova, Čēma I , RSU Zinātniskie raksti, 2:175-182. , 2010
• Genetic alterations in melanoma development. D Pjanova, Azarjana K, Čēma I, O Heisele , Proc. Latvian Acad. Sci. 63(3): 20-30 , 2009
• Melanoma. Agrīnas diagnostikas ietekme uz slimības prognozi Azarjana K, Čēma I, D Pjanova , DOCTUS 5:5-9. , 2008
• Analysis of Latvian melanoma families for 9p21 germline deletions by multiplex ligation-dependent probe amplification approach D Pjanova, O Heisele, Engele L, Randerson-Moor JA, Kukalizch K, Bishop DT, Newton Bishop JA , Acta Universitatis Latviensis 710:7-16. , 2006
• CDKN2A mutations and loss of heterozygosity in primary melanomas D Pjanova, Eņģele L, V Rovīte, O Heisele , Proc. Latvian Acad. Sci. Secion B. 60 (2/3):98:100. , 2006
• Tumour suppressor gene CDKN2A/p16 germline mutations in melanoma patients with additional cancer in their family history D Pjanova, O Heisele, Engele L, Desjatnikova I , Acta Universitatis Latviensis 662:25-32. , 2003
• Iedzimtība un slimības O Heisele, D Pjanova , Doctus 46-48 , 2003
• Echovirus-mediated biotherapy for malignant tumours: 40 years of invesigation. R Brūvere, O Heisele, Ferdats A, Rupais A, Mucenice A , Acta Medica Lituanica 9: 97-100 , 2002
• Double-stranded RNA induced by interferon in human cell cultures correlates with apoptosis D Pjanova, R Brūvere, Feldmane G, Volrāte Ā, Loža V , Proc. Latvian Acad. Sci. Secion B. 56 (1/2):24-29. , 2002
• Changes of mitotic regime in the malignant tumours. Ivanovs A, J Ērenpreisa , Jums, kolēģi 2: 34-39 , 2001
• Phenotypical characteristics of leukocyte membranes in Chernobyl clean-up workers from Latvia: use of the fluerescent probe ABM. Kalnina A, N Gabruševa, R Brūvere, Zvagule T, O Heisele, Volrāte Ā, Feldmane G, Meirovics I , Proc. Latvian Acad. Sci. 55(1): 6-14 , 2001
• Review: Endopolyploidy in development and cancer: A possible relation to genotoxic resistance of malignant tumours. J Ērenpreisa, Ivanov A , Proc. Latvian Acad. Sci. Vol. 56 , 2001

• Konferenču tēzes

• The role of autophagy in bi-potentiality, inter-sub-cellular heterogeneity, and fate choice of the DNA damaged cells of embryonal carcinoma A Hūna, J Ērenpreisa , EMBO/EMBL Symposium: Cellular Heterogeneity, Heidelberg 15-18 Apr., 2015, Poster 74, Abstact Book, p.100 , 2015
• Cell fate decision of PA1 cells treated with etoposide depends on competition between self-renewal and senescence regulators A Hūna, Jackson T, K Salmiņa, J Krigerts, Cragg M, Townsend P, J Ērenpreisa , EMBO/EMBL Symposium: Cellular Heterogeneity, Heidelberg 15-18 Apr., 2015, Poster 94, Abstact Book, p.120 , 2015
• Induction of stemness by genotoxic treatments in endopolyploid tumour cells of resistant tumours in vitro and in vivo B Geraschenko, K Salmiņa, L Ivanova, A Hūna, J Ērenpreisa , 15th International Congress of Radiation Research, 25-29 May 2015, Kyoto, Japan. Abstr. Book, p87 , 2015
• Changes of ploidy numbers and chromosome volumes in endopolyploid giant tumour cells induced by ionising irradiation J Ērenpreisa, A Hūna, Schwarz-Finsterle J, K Salmiņa, Scherthan H, Hausmann M , 15th International Congress of Radiation Research, 25-29 May 2015, Kyoto, Japan, Abstr. Book, p138 . , 2015
• DNA damage induced p53-dependent OCT4 prevents terminal senescence in PA1 teratocarcinoma cells after etoposide treatment A Hūna, Jackson T, K Salmiņa, J Krigerts, Vazquez-Martin A, I Iņaškina, J Ērenpreisa , 24th Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus, Vienna, Austria – 2015. Abstr. Book p.44. , 2015
• Spatial re-distribution of heterochromatin in senescing Etoposide-treated cells with reduced nuclear envelope confinement J Ērenpreisa, B Geraschenko, K Salmiņa, A Hūna, I Iņaškina, Pastova L, Belyayev A , 24th Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus, Vienna, Austria – 2015. Abstr. Book p.32 , 2015
• Nucleolar aggresomes and their possible traffic with ‘junk’ DNA K Salmiņa, A Hūna, Schwarz-Finsterle J, J Ērenpreisa , 24th Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus, Vienna, Austria – 2015. Abstr. Book p57. , 2015
• Cooperative organization and regulation of the chromatin in cell nuclei J Ērenpreisa, Giuliani A , International Conference Chromosoma 2015, Novosibrisk, Russia – 2015, Abst. Book, p.18. , 2015
• Visualisation of chromatin networks in interphase cell nuclei J Ērenpreisa, B Geraschenko, K Salmiņa, Krufczik M, Belyayev A, Pastova L, Hausmann M. , International Conference Chromosoma 2015, Novosibrisk, Russia – Abst. Book, p.19. , 2015
• The aneuploidy paradox in maligant tumours: Let us consider parasexual processes. J Ērenpreisa , EuroSciCon Pathology, Dec.1-3 2015, invited speaker. , 2015
• Evolution of life-cycles, sex, and cancer. J Ērenpreisa, Ianzini F, K Salmiņa, A Hūna, , Anatskaya O, Vinogradov AE, Giuliani A , Cragg MSThird International Biannual Evolution and Cancer Conference (IBEC 2015) , 2015
• Parasexual processes in embryonal carcinoma and lymphoblastoma cell cultures K Salmiņa, A Hūna, A.Belyayev, O.Raskina, H.Scherthan, T.Jackson, J Ērenpreisa , The Cell Cycle 2014, Ņujorka, ASV , 2014
• Dual P21CIP1/OCT4 expression and recovery after etoposide treatment in embryonal carcinoma cells pa1: impact of autophagy and serum concentration A Hūna, K Salmiņa, J Krigerts, Y.Dekthjar, B Geraschenko, J Ērenpreisa , escence Symposium, Londona, Lielbritānija , 2014
• The impact of serum concentration and autophagy on dual expression of opposite regulators of self - renewal and senecence Oct4/p21cip1 induced in etoposide - treated embryonal carcinoma A Hūna, K Salmiņa, J Krigerts, Y.Dekthjar, B.Gerashchenko, A.Ivanovs, J Ērenpreisa , Cancer stem cells 20 years later: Achievements, controversies, emerging concepts and technologies, Kantanzaro, Itālija , 2014
• Chromatin elimination and the survival strategies of endopolyploid multi-nuclear tumour cells induced by genotoxic treatments A Hūna, K Salmiņa, J Ērenpreisa, P. Anisimon Alim, R. Jackson Thomas, S. Cragg Mark , Cancer stem cells 20 years later: Achievements, controversies, emerging concepts and technologies, Kantanzaro, Itālija , 2014

Visas publikācijas

Ātrās saites

• BMC e-pasts
• Iepirkumi
• Iepirkumu arhīvs
• Masu medijiem
• EURAXESS

Grupas ātrās saites

• Pētniecība
• Zinātniskais personāls
• Sadarbības partneri
• Publikācijas

Aktuālie projekti

Visi grupas projekti

biomed.lu.lv © 2006-2019.



design & development by syndicate.lv